Hallo Oliver,
lt. Schaltplan ist der DC/DC-Wandler immer dreipolig ausgeführt, also nicht galvanisch getrennt.
Ich glaube auch nicht, dass man ihn auftrennen kann.
Selbst wenn statt der vermuteten Drossel ein Übertrager verbaut wurde (3 oder 4 Anschlüsse zur Platine), muss der Wandler nicht zwangsweise galvanisch getrennt sein.
Die elektronische Steuerung wäre etwas aufwändiger, weil der Primärseite (36/48V) ebenfalls galvanisch getrennt die Sollwerte für das Leistungsteil (Pulsbreite) "mitgeteilt" werden müssen. Das geschieht entweder durch kleine Übertrager oder Opto-Koppler.
Hast Du ein Problem damit, dass nicht beide Kreise getrennt sind?
Ein Umbau ist ohne "Totaloperation" nicht möglich, weil auf der Relaisplatine viele 36V-Relais, aber auch Steuerungen mit 12V und gemeinsamer Masse angeordnet sind.
Gruß